Sist oppdatert: 23.09.2020
Seksjonens mål er å benytte molekylære analyser på biobankmateriale og bioinformatiske metoder for å forstå kreftutvikling og utvikle kreftbiomarkører.
Seksjon for integrert kreftgenomikk er en ny seksjon på forskningsavdelingen som ble etablert i 2020. Forskningen er primært finansiert gjennom finansiering fra Kreftforeningen, Forskningsrådet og EUs forskningsprogram.
Seksjonen bruker data fra populasjons-baserte spørreundersøkelser, nasjonale helseregister og kliniske undersøkelser sammen med genomanalyser av biologisk materiale (genomikk) for å forstå kreftutvikling og utvikle nye kreftbiomarkører. Seksjonen bistår flere seksjoner med kompetanse innen bioinformatikk, genomikk, epigenetikk og mikrobiom.
Pågående prosjekt
CRCbiome - tarmbakterier og livstil ved tarmscreening
VegMeatCRC - bearbeidet kjøttinntak og tarmkreft
HPV-sekvensering for biomarkører
Epigenetikk og kreft
EradicateGBC
Fin-HIT - The Finnish Health in Teens study
Utvalgte publikasjoner
Raju SC, Viljakainen H, Figueiredo RAO, Neuvonen PJ, Eriksson JG, Weiderpass E, Rounge TB (2020)
Antimicrobial drug use in the first decade of life influences saliva microbiota diversity and composition
Microbiome, 8 (1), 121
DOI 10.1186/s40168-020-00893-y, PubMed 32825849
Cisplatin treatment of testicular cancer patients introduces long-term changes in the epigenome
Clin Epigenetics, 11 (1), 179
DOI 10.1186/s13148-019-0764-4, PubMed 31796056
Samarbeidspartnere
Torbjørn Rognes, Professor, University of Oslo
Eivind Hovig, Professor, University of Oslo and Oslo Universital Hospital
Ole Herman Ambur, Associate Professor, OsloMet
Robert Lyle, Core Facility Leader/Senior Scientist, Norwegian Sequencing Centre.
Vahid Bemanian, Senior engineer/researcher, Akershus University Hospital
Pekka Ellonen, Technology lab at FIMM, Helsinki, Finland
Irene Kraus Christiansen, Reseracher, Akershus University Hospital
Trine B Haugen, Professor, OsloMet
Justo Bermejo, Professor, University of Hiedelberg, Germany